Поскольку Японский архипелаг сильно вытянут с севера на юг, климат на различных островах заметно отличается друг от друга. Если на Хоккайдо царит классический климат умеренных широт с жарким летом и снежной зимой, то на южных островах Рюкю температура редко понижается ниже +13:+15 градусов.
Лучшее время для посещения Японии с туристической целью - конец марта-май и октябрь-ноябрь. Осенью на большей части территории страны не так жарко, как в летние месяцы, а весной можно наблюдать цветение сакуры - символа Японии.